La bio-informatique

La bio-informatique est un champ de recherche multi-disciplinaire où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie.

Depuis quelques années les progrès de l'informatique (et en particulier de labioinformatique mise au service de la biodiversité ou « Biodiversity informatics »pour les anglophones) dopent la biologie évolutive en offrant aux chercheurs un accès à un nombre croisant de données sur la diversité et les variation des gènes, ainsi que des génomes, des organismes et de l'environnement en général.
Tout cela peut être relié à la phylogénie (de l'étude des populations à celle de clades entiers), via de nouveaux protocoles et réseaux dans le domaine de l'informatique de la biodiversité

Le terme bio-informatique peut également décrire (par abus de langage) toutes les applications informatiques résultant de ces recherchesNote 1.

L'utilisation du terme bioinformatique est documentée pour la première fois en 1970 dans une publication1 de Paulien Hogeweg et Ben Hesper (université d'Utrecht, Pays-Bas), en référence à l'étude des processus d'information dans les systèmes biotiques2.

Cela va de l'analyse du génome à la modélisation de l'évolution d'une population animale dans un environnement donné, en passant par la modélisation moléculaire, l'analyse d'image, l'assemblage de génome et la reconstruction d'arbres phylogénétiques (phylogénie). Cette discipline constitue la « biologie in silico », par analogie avec in vitro ou in vivo.

Sommaire

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• 1 Définitions et champs d'application
• 2 Analyse de séquence
• 3 Modélisation moléculaire
• 4 Construction d'arbres phylogénétiques
• 5 Modélisation de population
• 6 Exemples de tâches et débouchés
• 7 Notes et références
  • 7.1 Notes
  • 7.2 Références
• 8 Voir aussi
  • 8.1 Articles connexes
  • 8.2 Liens externes